Во второй половине 1920-х годов активизируются подразделения Восточно-Сибирского отдела РГО. Так, в 1927 году секция Землеведения изучала промысловых зверей, лекарственные и технические растения Прибайкалья, составляла ботанико-географический очерк Яблонового хребта. М. Н. Назаров в составе ботанического отряда обследовал растительность западной части Хамар-Дабана, Тункинских и Китойских Альп. В 1928 году под руководством Ф. Ф. Шваба работала геологическая экспедиция «Золото Баргузина», ботаническая экспедиция — на Ононе. В 1929 году С. А. Арцыбашев изучал радиоактивность минеральных источников Тункинской котловины.
С 1926 года начинается углублённое изучение экономики. Экономическая секция, исследуя рыбные промыслы на Байкале, направила экспедицию М. В. Бородкиной в устье Селенги, в 1927 году ещё две — под руководством К. Н. Миротворцева, а также экспедицию М. П. Соколова по обследованию кедрового промысла. Летом 1929 года И. И. Веселов изучал омулёвые промыслы северо-восточного побережья Байкала, в 1930 году А. В. Гуревич — рыболовецкие артели в Баргузинском районе, А. И. Балдунников — в рамках экспедиции «Хозяйство и быт бурят в Иркутском округе» — бывшую «Нижнеудинскую землицу».
Результаты исследований публиковались в изданиях Отдела. Принципиальное значение имел выход первого после революции 46-го тома «Известий ВСОРГО». В 1921 году Восточно-Сибирский отдел издал работу В. П. Никитенко «Тункинские минеральные источники» и С. С. Турова «К вопросу о Баргузинском соболином заповеднике». С 1922 года издавался «Этнографический бюллетень», переименованный с 1924 года в «Бюллетень ВСО РГО». Эти работы получили широкое признание; так, на Всероссийской сельскохозяйственной выставке 1923 года Отдел был удостоен Диплома первой степени за издательскую деятельность. Особую известность получил этнографический журнал «Сибирская живая старина», выходивший с 1923 по 1928 гг. Издание оказалось настолько удачным, что в Резолюции 2-й Всесоюзной конференции по краеведению (декабрь 1924) оно было названо среди трёх лучших краеведческих изданий страны.
Иркутская областная универсальная научная библиотека им. И.И. Молчанова-Сибирского
Президентская библиотека им. Б.Н. Ельцина
Бернгард Петри (1884 — 1937)
Центральным событием для Байкальской региональной общественной науки 1920-х гг. стал Первый Восточно-Сибирский краеведческий съезд (Иркутск, январь 1925), в работе которого приняли участие представители 14 организаций Бурятии, 12 иркутских и одной Забайкальской организации. В 1927 году Госплан РСФСР избрал Отдел в качестве посредника по объединению местных организаций в разработке вопросов, связанных с изучением производительных сил. О роли Восточно-Сибирского отдела в организации экспедиционных работ свидетельствует тот факт, что в 1928 году он самостоятельно провёл треть всех экспедиций, осуществлённых организациями Иркутского округа, а все остальные возглавлялись членами Отдела. Поэтому плановые и хозяйственные органы региона рассматривали Восточно-Сибирский отдел как научно-исследовательский инструмент и постоянно привлекали к решению разнообразных задач.
Иркутская областная универсальная научная библиотека им. И.И. Молчанова-Сибирского
В конце десятилетия была ликвидирована филиальная сеть Географического общества. 22 декабря 1929 года Отдел преобразован в Восточно-Сибирское географическое общество (ВСГО).
В соответствии с решениями 4-й Всероссийской конференции по краеведению (март 1930) на фабриках, заводах, в колхозах, учреждениях, вузах и школах были созданы краеведческие ячейки, которыми руководили местные бюро краеведения. В связи с образованием Восточно-Сибирского края было создано Краевое общество изучения производительных сил Восточной Сибири, в состав которого вошли все отделения Географического общества, располагавшиеся на территории края.
Президиум Восточно-Сибирского крайисполкома 4 июня 1931 года постановил: «В целях развития краеведческой работы Общество изучения производительных сил Восточной Сибири и Восточно-Сибирское географическое общество реорганизовать в массовое краеведческое общество». Это означало, что время самодеятельных общественных научных организаций в Байкальском регионе закончилось. Более того, большинство активистов Восточно-Сибирского отдела оказались в списках врагов сталинского режима и были осуждены или расстреляны. Среди них А. В. Адрианов, В. Ч. Дорогостайский, Г. В. Ксенофонтов, Н. Н. Козьмин, П. К. Казаринов, В. С. Манассеин, И. Ф. Молодых, Б. Э. Петри, Ф. А. Кудрявцев, В. И. Подгорбунский и другие.
Несмотря на неблагоприятные обстоятельства, Отдел и образованные из него организации поддерживали творческие связи и обеспечивали преемственность дореволюционного и постреволюционного поколений учёных. Была сохранена сибирская научная школа, сформировавшая систему высшего образования в регионе, Восточно-Сибирский филиал СО АН СССР и позволившая возродить в послевоенное время ячейки Географического общества.